MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017432	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242287
2	NC_017432	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242287
3	NC_017432	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242287
4	NC_017432	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242287
5	NC_017432	T	6	6	1384	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	385242287
6	NC_017432	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242287
7	NC_017432	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242287
8	NC_017432	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242287
9	NC_017432	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242287
10	NC_017432	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	385242287
11	NC_017432	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242287
12	NC_017432	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242287
13	NC_017432	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242288
14	NC_017432	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242288
15	NC_017432	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242288
16	NC_017432	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	385242288
17	NC_017432	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	385242288
18	NC_017432	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242288
19	NC_017432	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242288
20	NC_017432	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242288
21	NC_017432	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242288
22	NC_017432	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	385242289
23	NC_017432	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242289
24	NC_017432	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	385242289
25	NC_017432	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242289
26	NC_017432	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242289
27	NC_017432	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242289
28	NC_017432	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242289
29	NC_017432	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242289
30	NC_017432	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242289
31	NC_017432	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242289
32	NC_017432	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242289
33	NC_017432	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242289
34	NC_017432	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242289
35	NC_017432	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	385242289
36	NC_017432	T	6	6	2828	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	385242289
37	NC_017432	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242289
38	NC_017432	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242289
39	NC_017432	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242289
40	NC_017432	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	385242289
41	NC_017432	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242289
42	NC_017432	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242289
43	NC_017432	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242289
44	NC_017432	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242289
45	NC_017432	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	385242289
46	NC_017432	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	385242289
47	NC_017432	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242289
48	NC_017432	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242289
49	NC_017432	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242289
50	NC_017432	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242289
51	NC_017432	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	385242290
52	NC_017432	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242290
53	NC_017432	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242290
54	NC_017432	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	385242290
55	NC_017432	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242290
56	NC_017432	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	385242290
57	NC_017432	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242290
58	NC_017432	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	385242290
59	NC_017432	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242290
60	NC_017432	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242290
61	NC_017432	A	7	7	4328	4334	100 %	0 %	0 %	0 %	385242290
62	NC_017432	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242290
63	NC_017432	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	385242290
64	NC_017432	A	7	7	4374	4380	100 %	0 %	0 %	0 %	385242290
65	NC_017432	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242290
66	NC_017432	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	385242290
67	NC_017432	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	385242290
68	NC_017432	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242290
69	NC_017432	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242290
70	NC_017432	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242290
71	NC_017432	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242290
72	NC_017432	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242290
73	NC_017432	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	385242290
74	NC_017432	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242290
75	NC_017432	AAAGCT	2	12	4941	4952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385242290
76	NC_017432	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	385242290
77	NC_017432	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242290
78	NC_017432	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242290
79	NC_017432	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242291
80	NC_017432	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242291
81	NC_017432	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242291
82	NC_017432	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	385242291
83	NC_017432	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242291
84	NC_017432	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	385242291
85	NC_017432	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	385242291
86	NC_017432	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242291
87	NC_017432	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242291
88	NC_017432	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	385242291
89	NC_017432	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	385242291
90	NC_017432	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242291
91	NC_017432	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242291
92	NC_017432	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242291
93	NC_017432	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242291
94	NC_017432	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242291
95	NC_017432	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242291
96	NC_017432	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	385242291
97	NC_017432	T	6	6	5610	5615	0 %	100 %	0 %	0 %	385242291
98	NC_017432	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242291
99	NC_017432	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242291
100	NC_017432	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	385242291
101	NC_017432	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242291
102	NC_017432	CTG	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242291
103	NC_017432	CAG	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242291
104	NC_017432	AG	3	6	5940	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	385242291
105	NC_017432	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	385242291
106	NC_017432	AGG	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242292
107	NC_017432	GAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242292
108	NC_017432	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	385242292
109	NC_017432	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	385242292
110	NC_017432	GCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242292
111	NC_017432	AAG	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242292
112	NC_017432	TGC	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242292
113	NC_017432	TCG	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242293
114	NC_017432	TCC	2	6	7358	7363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242293
115	NC_017432	GTT	2	6	7466	7471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242293
116	NC_017432	AC	3	6	7648	7653	50 %	0 %	0 %	50 %	385242293
117	NC_017432	T	6	6	7684	7689	0 %	100 %	0 %	0 %	385242293
118	NC_017432	TGGTA	2	10	7691	7700	20 %	40 %	40 %	0 %	385242293
119	NC_017432	AAGC	2	8	7821	7828	50 %	0 %	25 %	25 %	385242293
120	NC_017432	TTA	2	6	7836	7841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242293
121	NC_017432	A	6	6	7968	7973	100 %	0 %	0 %	0 %	385242293
122	NC_017432	T	6	6	8053	8058	0 %	100 %	0 %	0 %	385242293
123	NC_017432	TTC	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242293
124	NC_017432	ATTG	2	8	8219	8226	25 %	50 %	25 %	0 %	385242294
125	NC_017432	GAA	2	6	8303	8308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242294
126	NC_017432	AG	3	6	8391	8396	50 %	0 %	50 %	0 %	385242294
127	NC_017432	ACC	2	6	8431	8436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242294
128	NC_017432	CTT	2	6	8484	8489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242294
129	NC_017432	CT	4	8	8510	8517	0 %	50 %	0 %	50 %	385242294
130	NC_017432	GAG	2	6	8564	8569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242294
131	NC_017432	ATA	2	6	8581	8586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242294
132	NC_017432	GT	3	6	8592	8597	0 %	50 %	50 %	0 %	385242294
133	NC_017432	AGG	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242294
134	NC_017432	AGCG	2	8	8686	8693	25 %	0 %	50 %	25 %	385242294
135	NC_017432	AAAG	2	8	8707	8714	75 %	0 %	25 %	0 %	385242294
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273	NC_017432	GTA	2	6	15714	15719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242300
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299	NC_017432	A	6	6	16864	16869	100 %	0 %	0 %	0 %	385242301
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381	NC_017432	TCT	2	6	22079	22084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242306
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393	NC_017432	TGA	2	6	22913	22918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242306
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